روابط اقتصادی ایران و اسلام آباد همواره با نوسانات بسیاری همراه بوده که بیشتر تحت تاثیر عوامل بیرونی است. به غیر از تجارت مبادلهای برنج و برخی دیگر از کالاهای اساسی، دو طرف در مورد ساخت بازارچههای مرزی و جابجایی کامیونها تحت کنوانسیون حمل و نقل بین المللی کالا (TIR) برای دستیابی پاکستان به بازارهای اروپا و قفقاز و دسترسی ایران به بازار چین توافق کردهاند.